Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms