Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssxb8B1AY40 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssxb8B1AY40 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssxb8B1AY40 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssxb8B1AY40 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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