Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Prr29B1ARI9 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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Prr29B1ARI9 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Prr29B1ARI9 Gm28202-203ENSMUST00000189780 1157 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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Prr29B1ARI9 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 Tctex1d2-202ENSMUST00000080316 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Prr29B1ARI9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr29B1ARI9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr29B1ARI9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr29B1ARI9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr29B1ARI9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr29B1ARI9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr29B1ARI9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr29B1ARI9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr29B1ARI9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr29B1ARI9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr29B1ARI9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Prr29B1ARI9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prr29B1ARI9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr29B1ARI9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prr29B1ARI9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prr29B1ARI9 Arhgap6-202ENSMUST00000087016 1310 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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