Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Syndig1A2ANU3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms