Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Lcn6A2AJB9 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms