Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms