Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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