Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

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Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms