Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nme3Q9WV85 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms