Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vstm2bQ9JME9 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms