Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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