Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Tlr5Q9JLF7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Tlr5Q9JLF7 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Tlr5Q9JLF7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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Tlr5Q9JLF7 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Tlr5Q9JLF7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Tlr5Q9JLF7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Tlr5Q9JLF7 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Tlr5Q9JLF7 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms