Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gde1Q9JL56 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms