Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Scamp5Q9JKD3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms