Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl28Q9JIL2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms