Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ndufs3Q9DCT2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms