Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms