Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop7Q9DCH2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms