Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Pop5Q9DB28 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Pop5Q9DB28 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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Pop5Q9DB28 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Pop5Q9DB28 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Pop5Q9DB28 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Pop5Q9DB28 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Pop5Q9DB28 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Pop5Q9DB28 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pop5Q9DB28 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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