Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Subh2bvQ9D9Z7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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