Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Cldn22Q9D7U6 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Cldn22Q9D7U6 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn22Q9D7U6 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn22Q9D7U6 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn22Q9D7U6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Cldn22Q9D7U6 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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