Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms