Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms