Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Myo6-212ENSMUST00000184480 4139 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Dclre1b-201ENSMUST00000029435 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Mrpl55Q9CZ83 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms