Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup155Q99P88 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.6 ms