Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

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Length 1,463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims1Q99NE5 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rims1Q99NE5 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rims1Q99NE5 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms