Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms