Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PtprtQ99M80 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PtprtQ99M80 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Ppp1r11-203ENSMUST00000174711 520 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PtprtQ99M80 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PtprtQ99M80 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PtprtQ99M80 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PtprtQ99M80 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PtprtQ99M80 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PtprtQ99M80 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PtprtQ99M80 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PtprtQ99M80 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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