Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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