Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pacsin3Q99JB8 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms