Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hecw1Q8K4P8 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms