Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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