Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Brf1Q8CFK2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms