Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms