Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms