Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Pramef8Q8CE24 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pramef8Q8CE24 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms