Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

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Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Lrrc9Q8CDN9 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Lrrc9Q8CDN9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Lrrc9Q8CDN9 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Lrrc9Q8CDN9 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Lrrc9Q8CDN9 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Lrrc9Q8CDN9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Lrrc9Q8CDN9 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Lrrc9Q8CDN9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Lrrc9Q8CDN9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc9Q8CDN9 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms