Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Lrif1Q8CDD9 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Lrif1Q8CDD9 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Lrif1Q8CDD9 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrif1Q8CDD9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrif1Q8CDD9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrif1Q8CDD9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrif1Q8CDD9 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrif1Q8CDD9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrif1Q8CDD9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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