Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Atg4aQ8C9S8 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Atg4aQ8C9S8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Atg4aQ8C9S8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Atg4aQ8C9S8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Atg4aQ8C9S8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Atg4aQ8C9S8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Atg4aQ8C9S8 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Atg4aQ8C9S8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Atg4aQ8C9S8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Atg4aQ8C9S8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Atg4aQ8C9S8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Atg4aQ8C9S8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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