Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Amigo3Q8C2S7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm23916-201ENSMUST00000158484 399 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Amigo3Q8C2S7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms