Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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FarsaQ8C0C7 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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FarsaQ8C0C7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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