Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms