Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms