Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp40Q8BWR4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp40Q8BWR4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp40Q8BWR4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp40Q8BWR4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp40Q8BWR4 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp40Q8BWR4 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp40Q8BWR4 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp40Q8BWR4 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp40Q8BWR4 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp40Q8BWR4 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp40Q8BWR4 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp40Q8BWR4 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp40Q8BWR4 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp40Q8BWR4 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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