Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cxcl16Q8BSU2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms