Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp54Q8BL06 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms