Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms