Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms