Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Atg4bQ8BGE6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Atg4bQ8BGE6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Atg4bQ8BGE6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Atg4bQ8BGE6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Atg4bQ8BGE6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms