Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms